신약 개발 유효 물질 (Hit) 도출을 위한
그래프 도달 가능성 알고리즘
현대 생물학적 기전과 화학적 공간 탐색을 통합하는 차세대 추론 엔진 분석 보고서
개요 및 핵심 원리
유효 물질 도출은 단순 결합력을 넘어 질병 맥락에서의 기전적 타당성 확보가 필수적입니다. 본 알고리즘은 다음 두 가지 그래프를 핵심 엔진으로 활용합니다.
- 생물학적 지식 그래프: 유전자·단백질·질병 노드 간 인과성 평가
- 분자 구조 그래프: 원자·프래그먼트 기반 합성 가능성 탐색
기술적 방법론
- 01. 맥락화된 KG 구축 (가중치 할당)
- 02. 제약 기반 질의 (A* / Yen's algorithm)
- 03. 복합 경로 점수화 및 가설 검증
2025-26 연구 동향
K-Paths (2025)
LLM/GNN 입력용 논리적 사슬 추출
BioPathNet (2026)
NBFNet 기반 링크 예측 성능 극대화
한계점 및 극복
- 데이터 잡음: 하이브리드 필터링 적용
- 경로 폭발: 빔 가지치기(Beam Pruning) 활용
- 인과관계 추론: 확률론적 인과 층 추가
- 실험 간극: Assay 파이프라인 연동